狗狗近亲繁殖中重要的是两只狗狗的身体是否有着一定的缺陷，不然这个缺点会一直传承下去。近亲繁殖并不能起到改良的作用，只能保持和发扬该血系的优点和缺点。该血系的犬中存在同一个缺点时，这个缺点在这个血系的存在就是永久性的。
当一种纯种动物，近乎绝种时，要将它进行繁衍，是很困难的。因为是很难找到几头这样的动物，就算能找到，它们也不一定是适合繁殖的。且在适合繁殖的一小部分中，它们大多是兄弟姊妹或同血缘的。但在这个没有选择的时候，只要是雌性而又适龄时，便要作交配，便要用近亲繁殖。但在这情形下繁殖，出现劣的机会较大，因为由于繁殖对象本身的血缘相近，可能两者都有同一缺点。所以在这种情况下，便要不得已地把劣的慢慢淘汰，慢慢改良。
当发现该血系的犬中存在同一个缺点时，这个缺点在这个血系的存在就是永久性的。这时如依旧使用近亲繁殖的方法，只会使这个缺点越来越明显。众所周知的，德国牧羊犬就是近亲繁殖的产物，德国牧羊犬的髋关节异常是一种发病率较高的遗传疾病。德国牧羊犬协会为了尽力避免由遗传疾病带来的缺点，才规定了三代以内禁止近亲繁殖。
